Helaas is deze vacature inmiddels waarschijnlijk verlopen

Postdoc Public Health mycologie, RIVM

Voor de duur van 12 maanden, van 1 maart 2022 tot 1 maart 2023
Uren per week
36
Maand­salaris
€2.811

€5.139
Salaris­niveau
schaal 10, schaal 11
Niveau
Gepromoveerd
Vakgebied
Onderzoek / wetenschap
Reageren voor
31 januari
Nog 1 dag
Vacaturenummer
I&V-IDS-126
Plaatsingsdatum
15 januari 2022
Dienst­verband
Arbeidsovereenkomst voor bepaalde tijd met uitzicht op onbepaalde tijd
Ben jij een gepromoveerd microbioloog en wil je graag bijdragen aan onze volksgezondheid? Heb je interesse in schimmels en de techniek whole genome sequencing? Wil jij met jouw onderzoek graag bijdragen aan het voorkomen of bestrijden van ziekte door schimmels in de toekomst? Dan is deze postdoc positie interessant voor jou.

De afdeling
Bij het RIVM werken ruim 2200 collega’s elke dag samen aan de mogelijke zorgen van morgen. Binnen het centrum IDS werken ongeveer 30 collega’s van de afdeling BPD aan de diagnostiek, surveillance en onderzoek van diverse pathogenen. Het is een gezellig/professioneel/ambitieus team wat zich typeert door intensieve samenwerking met een breed scala aan interne en externe partners.

Onderzoek
Een van de nieuwe onderzoeksgebieden binnen onze afdeling zijn schimmels. Schimmels vormen een toenemend probleem voor de publieke gezondheid. Door veranderingen in hun habitat (het milieu) en door nieuwe medische behandelingen van de mens, zoals antibiotica en medicatie die ingrijpt op de immunologische afweer, is er een toename van patiënten met ernstige invasieve schimmelinfecties. Ook bij patiënten die op de intensive care zijn opgenomen met influenza of coronavirus infecties (SARS-CoV2) worden secundaire infecties met schimmels gerapporteerd, waarbij zelfs patiënten die voorheen gezond waren invasieve aspergillose ontwikkelen. Niet alleen een toename van het aantal infecties met Aspergillus, maar ook de snel ontwikkelende resistentie tegen beschikbare anti-schimmelmedicatie is een groeiend probleem. Interventies zijn dus noodzakelijk om verdere escalatie te voorkomen en de technieken en methoden beschreven binnen dit project leiden tot inzichten die gerichte interventies mogelijk maken.

Doelstelling
De focus van deze positie ligt op het opzetten en coördineren van schimmelonderzoek binnen het RIVM middels een moleculair surveillance platform. Het doel is om een beter inzicht te verkrijgen in het voorkomen van (resistente) gisten en schimmels van mens en milieu en het in kaart brengen van de transmissie routes van hun habitat naar de patiënt. Deze opzet past in een algemener streven naar “preparedness en response” voor de opkomst van nieuwe (resistente) ziekmakende micro-organismen met als doel om snel effectieve interventies te kunnen ontwikkelen.

Als postdoc speel je daarnaast een rol in het opzetten van de nationale Aspergillus surveillance door middel van whole genome sequencing en breng je het mycobioom, het totaal aan gisten en schimmels op een bepaalde plek, in kaart. Een ander belangrijk aspect is het uitzoeken welke analysemethode het best ingezet kan worden voor het analyseren van de data.

Op het lab heb je voor je onderzoek de beschikking over state-of-the-art apparatuur en krijg je ondersteuning van onze zeer bekwame en enthousiaste analisten. Je kunt dus zo aan de slag!

Werkzaamheden en taken

• je coördineert het mycologie onderzoek en zorgt voor de inhoudelijke aansturing van de betrokken analisten;
• je bent verantwoordelijk voor het versterken en uitbouwen van de verdiepende Aspergillus surveillance;
• je bent op de hoogte van recente ontwikkelingen op het vakgebied mycologie en op het gebied van sequencing;
• je ontwikkelt data-analyse methodes voor het verwerken van sequencedata van schimmels;
• je voert data-analyses op basis van de verkregen genomische data en data uit de publieke databases;
• je presenteert en publiceert de resultaten op (inter)nationale congressen en in wetenschappelijk tijdschriften;
• je werkt nauw samen met (inter)nationale stakeholders, zoals ziekenhuizen, universiteiten en andere collega onderzoekers.

Uniek aan deze baan
Op deze positie krijg je veel ruimte om je eigen ideeën in te brengen voor het onderzoek. Je werkt binnen een omgeving van wetenschappers en daarmee profiteer je van veel kennis en ervaring om je heen, wat jouw leercurve ten goede komt. Je staat mede aan de voet van vernieuwende techniek; want met het sequencen van schimmels is nog weinig ervaring opgedaan. Ondanks dat, is de infrastructuur helemaal op orde. Zo zorgt het in-house sequencing team ervoor dat jouw ‘genomen’ gesequencet worden en heb je een High Performance Cluster tot je beschikking om voor jou de analyses uit te voeren. Daardoor krijg jij alle ruimte voor het daadwerkelijke onderzoek en voor het delen van kennis met anderen die bezig zijn op dit gebied. Het RIVM werkt in dit onderzoek nauw samen met het Radboudumc. Jij wordt begeleidt door RIVM afdelingshoofd Thijs Bosch en mede begeleid door hoogleraar klinische mycologie van het Radboudumc Paul Verweij.

De zorg voor morgen begint vandaag
meer...



Meer vacatures van Werken voor Nederland